新型コロナウイルス変異株とは

コロナ関連情報（別ページ）

　〇変異株スクリーニング検査受託開始について　→　変異株検査

　〇安全なワクチン接種の為に　→　ワクチンとは

　〇ＰＣＲ検査ご提出方法等について　→　ご提出方法

　〇日本からの各国・地域の入国制限措置等について　→　＊PCR検査方法等、入国条件について

変異の起こる仕組み

〇ウイルスの特徴〇
ウイルスは、蛋白質の外殻、内部に遺伝子（DNA、RNA）を持っただけの単純な構造の微生物です。細菌のように栄養を摂取してエネルギーを生産するような生命活動は行いません。たとえ栄養と水があったとしても、ウイルス単独では生存できません。自分自身で増殖する能力が無く、生きた細胞の中でしか増殖できませんので、他の生物を利用して自己を複製することでのみ増殖します。その過程で「変異」を繰り返し、より環境に適応しやすいよう姿を変えていきます。

＜変異の過程＞

➀まず、ウイルス表面にある、とげ状の「スパイクたんぱく質」が、ヒトの細胞表面で受け手となる受容体たんぱく質（アンジオテンシン変換酵素2＝ACE2）に結合して細胞内へ侵入する。

➁細胞内では、RNAの情報に従って、ウイルスの素材となるたんぱく質を翻訳（合成）する。一方、RNAは大量に複製され、たんぱく質とともに組み立て・成熟が進んで「子孫ウイルス」ができ、それらが細胞外へ放出されていく。

➂この過程で、RNA複製の際に一定の確率でミスが生じ、RNAを構成する塩基の配列が変わることがある。この現象が「変異」と呼ばれる。

新型コロナにおける変異株

　国が監視を続ける主な変異株は英国、南アフリカ、ブラジルで報告されている三種類だ。厚生労働省の集計では十六日時点で、これら三カ国由来の国内感染例は三百九十九人。うち三百七十四人が英国由来だ。前回発表の九日時点から五道県が増え、感染は二十六都道府県に広がった。

１. N501Yの変異のある変異株

• 「N501Yの変異がある変異株」は、従来株よりも感染しやすい可能性がある。

•　英国で確認された変異株(VOC-202012/01)､南アフリカで確認された変異株(501Y.V2)、ブラジルで確認された変異株(501Y.V31)､フィリピンで確認された変異株がこの変異を有している。

•　英国や南アフリカで確認された変異株については、重症化しやすい可能性も指摘されている。

•　4/6時点、国内事例886例、空港検疫152例の計1038例が確認されている。

２. E484Kの変異がある変異株

• 「E484Kの変異がある変異株」は、従来株よりも、免疫やワクチンの効果を低下させる可能性^※１可能性も指摘されている。

•　南アフリカで確認された変異株(501Y.V2)、ブラジルで確認された変異株（501Y.V3）、フィリピンで確認された変異株がこの変異を有している。

　※１この変異のみでワクチンが無効化されるものではなく、ファイザー社のワクチンの場合は、承認審査において、モデルウイルスを用いた非臨床試験を通じ、種々の変異株にも一定の有効性が期待できるが、今後も変異を注視し、引き続き検討が必要とされている。

　※ 上記のほかに、我が国では「N501Yの変異はないがE484Kの変異がある変異株」を計1,553例（国内1,548件、検疫5件）確認されている(2021/4/6時点)

３. L452RとE484Qの変異がある変異株

•　インド由来とされ、英国株に続く「脅威」となると専門家が危ぶんでいる。
特にアジア系人種について免疫やワクチンの効果を低下させる可能性が指摘されている。

•　インドの感染、１日３４万人インドの感染、１日３４万人。

•　世界保健機関（ＷＨＯ）は４月下旬、インド株を「ＶＯＩ（注目すべき変異株）」に指定した。

	Ｌ４５２Ｒ	Ｅ４８４Ｑ
感染力	感染力が強い	不明
免疫への影響	免疫力を低下させる	不明

４. その他、世界で確認されている変異株

　delH69V70、N501Y、E484K、K417N、K417T、N439K、D614G、A222V、Y453F、P681H、 Q27stop、delY144、A570D、T716I、S982A、A1708D、A701V、L242_244L、D80A、L18F、 R246I、D215G

N501Y・E484Kってなに

　最近、よく聞くけどN501Y・E484Kってなに？？

　「まん延防止」が適用された大阪。４月５日に発表されたスクリーニング検査の結果、新たに２７０人が変異ウイルス陽性だったことがわかりました。その変異ウイルス、日本では気になる２つの変異の種類があるんです。

「Ｎ５０１Ｙ」の変異があるのはイギリス型と呼ばれるもので、特に関西で広がっています。一方、「Ｅ４８４Ｋ」のみの変異があるのはどこからきたタイプかはわかっていませんが、東京の陽性者のうち、およそ半数を占めています。

この数字とアルファベットが何なのかといいますとウイルスには人の細胞にくっつく重要な「突起」があるんですが、タンパク質の「５０１番目のアミノ酸がＮ（アスパラギン）からＹ（チロシン）に変わった」ということを示しています。変異そのものは頻繁に起こっているといいます。

アミノ酸略号

和名	英名	略号		和名	英名	略号
アラニン	Alanine	Ala	A	ロイシン	Leucine	Leu	L
アルギニン(B)	Arginine	Arg	R	リシン(B)	Lysine	Lys	K
アスパラギン	Asparagine	Asn	N	メチオニン	Methionine	Met	M
アスパラギン酸(A)	Aspartic Acid	Asp	D	フェニルアラニン	Phenylalanine	Phe	F
システイン	Cysteine	Cys	C	プロリン	Proline	Pro	P
グルタミン	Glutamine	Gln	Q	セリン	Serine	Ser	S
グルタミン酸(A)	Glutamic Acid	Glu	E	トレオニン	Threonine	Thr	T
グリシン	Glycine	Gly	G	トリプトファン	Tryptophan	Trp	W
ヒスチジン(B)	Histidine	His	H	チロシン	Tyrosine	Tyr	Y
イソロイシン	Isoleucine	Ile	I	バリン	Valine	Val	V
注：表中（A）：酸性アミノ酸、（B）：塩基性アミノ酸

＜その他変異＞

－ del 69-70とは－

➀VOC-202012/01の変異の一つ、S遺伝子deletion 69-70により、S遺伝子を検出するPCRによっては、結果が偽陰性となるspike gene target failure (SGTF)を認めている

➁英国の3カ所の検査施設において、SGTF を認める検体が急増するとともに、10月12日の週にはSGTFを認める変異株のうちB.1.1.7に属するものが5%であったが、11月30日にはこの頻度が96%と急増していた

変異するとどうなる

「Ｎ５０１Ｙ」、「Ｅ４８４Ｋ」変異の特徴は、

＜変異の種類と特徴＞

➀関西で多い「Ｎ５０１Ｙ」は、従来よりも感染力が強いとされています。一方、東京で多い「Ｅ４８４Ｋ」は、感染力は従来と変わらないとされています。東京よりも大阪の感染者が多いのはこのことも影響しているのかもしれません。

➁「イギリス型」「南アフリカ型」「ブラジル型」と呼ばれているウイルスなどはこの「Ｎ５０１Ｙ」の変異が見られ、「イギリス型」に限れば致死率は従来のおよそ１．６倍という報告もあります。一方、「南アフリカ型」「ブラジル型」などには「Ｅ４８４Ｋ」の変異もあります。この変異の注目すべき特性は「免疫やワクチンの効果を低下させる可能性」が指摘されている点です。

➂「変異によってワクチンの効果を弱めるものも出てくる可能性がある。『Ｅ４８４Ｋ』がそれであるという確証はないが短期間で感染を押さえ込むことが重要だ」

＜変異すると＞

「Ｌ４５２Ｒ」変異の特徴は、

・インド型変異株ウイルスともいわれる

・日本人の６割が新型コロナウイルスに対する免疫反応・ワクチン効果が弱くなる

・原因は白血球の血液型であるHLA（ヒト白血球抗原）

白血球とは

・白血球とは血液の工場である骨髄（こつずい）中で作られる血液細胞です。

・ばい菌、ウイルス、カビなどから身を守るためにはたらきます。

・ひとくちに白血球と言っても白血球の中にはいろいろな種類があり、それぞれ役割が異なります。（好中球、好酸球、好塩基球、リンパ球、単球）

・白血球にも血液型があります。（HLA；ヒト白血球抗原）

＜HLA（Human Leukocyte Antigen＝ヒト白血球抗原）とは＞
HLA（Human Leukocyte Antigen＝ヒト白血球抗原）は1954年、白血球の血液型として発見され、頭文字をとってこう呼ばれてきました。しかし、発見から半世紀以上を経て、HLAは白血球だけにあるのではなく、ほぼすべての細胞と体液に分布していて、組織適合性抗原(ヒトの免疫に関わる重要な分子)として働いていることが明らかになりました。

日本国内におけるA, B, DRの頻度は下記のようになっています。日本人の６割がHLA-A24を持っています。

Ａ	Ｂ	ＤＲ	ＨＦ	ＬＤ
Ａ２４	Ｂ５２	ＤＲ１５	８．２％	７．５
Ａ３３	Ｂ４４	ＤＲ１３	５．２％	５．１
Ａ２４	Ｂ７	ＤＲ１	３．６％	３．５
Ａ２４	Ｂ５４	ＤＲ４	２．３％	１．８
Ａ２	Ｂ４６	ＤＲ８	２．２％	２．１

HLAハプロタイプの頻度

Ａ　　　　　Ｂ　　　　　ＤＲ　　　　ＨＦ（％）　ＬＤ
Ａ２４　　　Ｂ５２　　　ＤＲ１５　　８．２％　　７．５
Ａ３３　　　Ｂ４４　　　ＤＲ１３　　５．２％　　５．１
Ａ２４　　　Ｂ７　　　　ＤＲ１　　　３．６％　　３．５
Ａ２４　　　Ｂ５４　　　ＤＲ４　　　２．３％　　１．８
Ａ２　　　　Ｂ４６　　　ＤＲ８　　　２．２％　　２．１
Ａ１１　　　Ｂ６２　　　ＤＲ４　　　１．６％　　１．４
Ａ２６　　　Ｂ６１　　　ＤＲ９　　　１．２％　　１．１
Ａ２　　　　Ｂ６１　　　ＤＲ９　　　１．２％　　０．８
Ａ２　　　　Ｂ３５　　　ＤＲ４　　　１．２％　　０．８
Ａ２４　　　Ｂ６１　　　ＤＲ９　　　１．２％　　０．７
Ａ２４　　　Ｂ３５　　　ＤＲ４　　　１．１％　　０．４
Ａ２４　　　Ｂ５１　　　ＤＲ４　　　１．０％　　０．３
Ａ２　　　　Ｂ１３　　　ＤＲ１２　　０．９％　　０．９
Ａ２４　　　Ｂ５９　　　ＤＲ４　　　０．９％　　０．８
Ａ３１　　　Ｂ５１　　　ＤＲ８　　　０．８％　　０．７
Ａ２６　　　Ｂ６２　　　ＤＲ９　　　０．８％　　０．７
Ａ２６　　　Ｂ３５　　　ＤＲ１５　　０．８％　　０．７
Ａ１１　　　Ｂ５４　　　ＤＲ４　　　０．８％　　０．７
Ａ２　　　　Ｂ４６　　　ＤＲ９　　　０．８％　　０．６
Ａ２４　　　Ｂ６２　　　ＤＲ４　　　０．８％　　０．１
Ａ１１　　　Ｂ６７　　　ＤＲ１５　　０．７％　　０．７
Ａ２　　　　Ｂ５９　　　ＤＲ４　　　０．７％　　０．６
Ａ２　　　　Ｂ３９　　　ＤＲ１５　　０．７％　　０．６
Ａ１１　　　Ｂ３９　　　ＤＲ８　　　０．７％　　０．６
Ａ２６　　　Ｂ６２　　　ＤＲ１５　　０．７％　　０．５
Ａ２　　　　Ｂ６０　　　ＤＲ４　　　０．７％　　０．４
Ａ３３　　　Ｂ４４　　　ＤＲ８　　　０．６％　　０．５
Ａ２４　　　Ｂ５５　　　ＤＲ４　　　０．６％　　０．３
Ａ２４　　　Ｂ５４　　　ＤＲ８　　　０．６％　　０．３
Ａ２　　　　Ｂ３９　　　ＤＲ４　　　０．６％　　０．３
Ａ２４　　　Ｂ６０　　　ＤＲ４　　　０．６％　　０．１
Ａ２　　　　Ｂ６１　　　ＤＲ４　　　０．６％　　０．０
Ａ２４　　　Ｂ５２　　　ＤＲ８　　　０．５％　　－０．１
Ａ３１　　　Ｂ５１　　　ＤＲ１２　　０．５％　　０．５
Ａ３１　　　Ｂ６０　　　ＤＲ８　　　０．５％　　０．４
Ａ２４　　　Ｂ７０　　　ＤＲ４　　　０．５％　　０．４
Ａ２　　　　Ｂ７　　　　ＤＲ１　　　０．５％　　０．４
Ａ２６　　　Ｂ３５　　　ＤＲ４　　　０．５％　　０．３
Ａ２４　　　Ｂ６０　　　ＤＲ９　　　０．５％　　０．３
Ａ２　　　　Ｂ４８　　　ＤＲ１５　　０．５％　　０．３
Ａ１１　　　Ｂ３５　　　ＤＲ４　　　０．５％　　０．３
Ａ２６　　　Ｂ５２　　　ＤＲ１５　　０．５％　　０．２
Ａ２４　　　Ｂ６１　　　ＤＲ１２　　０．５％　　０．２
Ａ２４　　　Ｂ４６　　　ＤＲ８　　　０．５％　　０．２
Ａ２　　　　Ｂ６２　　　ＤＲ１５　　０．５％　　０．２
Ａ２　　　　Ｂ５４　　　ＤＲ４　　　０．５％　　０．２
Ａ２４　　　Ｂ５１　　　ＤＲ８　　　０．５％　　０．１
Ａ２４　　　Ｂ５１　　　ＤＲ９　　　０．５％　　０．１
Ａ２　　　　Ｂ６１　　　ＤＲ８　　　０．５％　　０．１
Ａ２４　　　Ｂ６１　　　ＤＲ１５　　０．４％　　－０．２
Ａ３３　　　Ｂ５８　　　ＤＲ１３　　０．４％　　０．４
Ａ　　　　　Ｂ４８　　　ＤＲ４　　　０．４％　　０．４
Ａ２　　　　Ｂ７５　　　ＤＲ９　　　０．４％　　０．４
Ａ１　　　　Ｂ３７　　　ＤＲ１０　　０．４％　　０．４
Ａ３１　　　Ｂ５１　　　ＤＲ９　　　０．４％　　０．３
Ａ２４　　　Ｂ５１　　　ＤＲ１１　　０．４％　　０．３
Ａ２４　　　Ｂ５１　　　ＤＲ２５　　０．４％　　０．３
Ａ２４　　　Ｂ３５　　　ＤＲ１１　　０．４％　　０．３
Ａ２　　　　Ｂ６１　　　ＤＲ１４　　０．４％　　０．３
Ａ２　　　　Ｂ５１　　　ＤＲ１２　　０．４％　　０．３
Ａ３１　　　Ｂ５１　　　ＤＲ４　　　０．４％　　０．２
Ａ２６　　　Ｂ６１　　　ＤＲ８　　　０．４％　　０．２
Ａ２４　　　Ｂ６１　　　ＤＲ１４　　０．４％　　０．２
Ａ２４　　　Ｂ３５　　　ＤＲ１４　　０．４％　　０．２
Ａ２　　　　Ｂ５４　　　ＤＲ８　　　０．４％　　０．２
Ａ２　　　　Ｂ４４　　　ＤＲ１３　　０．４％　　０．２
Ａ２４　　　Ｂ６０　　　ＤＲ１５　　０．４％　　０．１
Ａ２　　　　Ｂ３５　　　ＤＲ１５　　０．４％　　０．１
Ａ２４　　　Ｂ３５　　　ＤＲ１５　　０．３％　　－０．２
Ａ２４　　　Ｂ７　　　　ＤＲ４　　　０．３％　　－０．１
Ａ２４　　　Ｂ３５　　　ＤＲ９　　　０．３％　　－０．１
Ａ２　　　　Ｂ５２　　　ＤＲ１５　　０．３％　　－０．１
Ａ３１　　　Ｂ５１　　　ＤＲ２５　　０．３％　　０．３
Ａ２６　　　Ｂ３５　　　ＤＲ１４　　０．３％　　０．３
Ａ２４　　　Ｂ６１　　　ＤＲ１５　　０．３％　　０．３
Ａ１１　　　Ｂ６７　　　ＤＲ１６　　０．３％　　０．３
Ａ１１　　　Ｂ５５　　　ＤＲ１４　　０．３％　　０．３
Ａ３１　　　Ｂ６１　　　ＤＲ８　　　０．３％　　０．２
Ａ３１　　　Ｂ５６　　　ＤＲ９　　　０．３％　　０．２
Ａ２６　　　Ｂ６２　　　ＤＲ８　　　０．３％　　０．２
Ａ２６　　　Ｂ６０　　　ＤＲ１２　　０．３％　　０．２
Ａ２６　　　Ｂ４８　　　ＤＲ４　　　０．３％　　０．２
Ａ２４　　　Ｂ５１　　　ＤＲ９　　　０．３％　　０．２
Ａ２４　　　Ｂ６７　　　ＤＲ４　　　０．３％　　０．２
Ａ２　　　　Ｂ６０　　　ＤＲ９　　　０．３％　　０．２
Ａ１１　　　Ｂ４８　　　ＤＲ９　　　０．３％　　０．２
Ａ１１　　　Ｂ３５　　　ＤＲ８　　　０．３％　　０．２
Ａ２６　　　Ｂ６２　　　ＤＲ４　　　０．３％　　０．１
Ａ２６　　　Ｂ６１　　　ＤＲ４　　　０．３％　　０．０
Ａ２　　　　Ｂ６２　　　ＤＲ９　　　０．３％　　０．０
Ａ２　　　　Ｂ５１　　　ＤＲ８　　　０．３％　　０．０
Ａ２　　　　Ｂ５１　　　ＤＲ９　　　０．３％　　０．０
Ａ２　　　　Ｂ３５　　　ＤＲ８　　　０．３％　　０．０
Ａ３　　　　Ｂ４４　　　ＤＲ１３　　０．２％　　０．２
Ａ２６　　　Ｂ６２　　　ＤＲ１４　　０．２％　　０．２
Ａ２　　　　Ｂ４６　　　ＤＲ１２　　０．２％　　０．２
Ａ３１　　　Ｂ６１　　　ＤＲ９　　　０．２％　　０．１
Ａ３１　　　Ｂ６１　　　ＤＲ４　　　０．２％　　０．１
Ａ２　　　　Ｂ７０　　　ＤＲ４　　　０．２％　　０．１
Ａ２　　　　Ｂ５５　　　ＤＲ４　　　０．２％　　０．１
Ａ２　　　　Ｂ４８　　　ＤＲ４　　　０．２％　　０．１
Ａ２　　　　Ｂ３９　　　ＤＲ９　　　０．２％　　０．１
Ａ２　　　　Ｂ３５　　　ＤＲ９　　　０．２％　　０．０

“白血球の型”

ＨＬＡ－Ａ２４

日本人の６割が保有

＜L452R変異による影響＞

日本人の６割が新型コロナウイルスに対する免疫反応・ワクチン効果が弱くなる

オミクロン株の特徴は、

・オミクロン株は南アフリカが２０２１年１１月２４日に初めて世界保健機関（ＷＨＯ）に報告した新型コロナウイルスの変異株。ＷＨＯはアルファ株（英国）ベータ株（南アフリカ）ガンマ株（ブラジル）デルタ株（インド）に続く５番目の「懸念される変異株（ＶＯＣ）」に指定した。

新しい変異株の分類と呼称

　WHOは懸念される変異株と注目すべき変異株について、最初に検出された国や地域が呼称の一部として用いられることによる偏見の懸念から、2021年5月31日にギリシャ文字を使用した新たな呼称を提唱した。

＜変異株の分類と呼称＞

2021年11⽉29⽇時点

WHOラベル

alpha

アルファ

beta

ベータ

gamma

ガンマ

delta

デルタ

epsilon

イプシロン

dzeta

ゼータ

eta

イータ

theta

シータ

iota

イオタ

kappa

カッパ

lambda

ラムダ

ミュー

発見年月
発見された国

2020.09

イギリス

2020.05

南アフリカ

2020.11

ブラジル

2020.10

インド

2020.05

アメリカ

2020.11

イギリス

2020.12

複数国

2021.02

フィリピン

2020.11

アメリカ

2020.10

インド

2020.12

ペルー

2021.01

コロンビア

重要性に
よる分類

VOC

VUM

VOI

WHOラベル

ny
ニュー

ξ
xi
クサイ

ο
omicron
オミクロン

π
pi
パイ

ρ
rho
ロー

σ
sigma
シグマ

τ
tau
タウ

υ
ypsilon
ウプシロン

φ
phi
ファイ

χ
khi
カイ

ψ
psi
プサイ

ω
omega
オメガ

発見年月
発見された国

使用されず

2021.11
南アフリカ

重要性に
よる分類

VOC

VOC：懸念される変異株(Variant of Concern)
VOI：注目すべき変異株(Variant of Interest)
VUM：監視中の変異株(Variant under Monitoring)
空白：以前監視されていた変異株(formerly monitored variants)

＜変異株の分類と系統＞

2021年11⽉29⽇時点

分類（WHO）	WHOの呼称	Pango系統	GISAID クレード	Nextstrain クレード
	アルファ（α）	B.1.1.7	GRY (旧 GR/501Y.V1)	20I(V1)
VOC^※１	ベータ（β）	B.1.351 B.1.351.1 ~ B.1.351.5	GH/501Y.V2	20H(V2)
	ガンマ（γ）	P.1 P.1.1 ~ P.1.17	GR/501Y.V3	20J(V3)
	デルタ（δ）	B.1.617.2 AY.1 ~ AY.125	G/478K.V1	21A･S:478
	オミクロン（ο）	B.1.1.529	GR/484A	21K
VOI^※２	ラムダ（λ）	C.37	GR/452Q.V1	21G
VOI^※２	ミュー（μ）	B1.621	GH	21H
VUM^※３	イオタ（ι）	B.1.526	GH/253G.V1	21F
	カッパ（κ）	B.1.617.1	G/452R.V3	21B
	イータ（η）	B.1.525	G/484K.V3	21D
formerly monitored variants ^※４	イプシロン（ε）	B.1.427 B.1.429	GH/452R.V1	21C
	ゼータ（ζ）	P.2	GR/484K.V2	20B/S:484K
	シータ（θ）	P.3	GR/1092K.V1	21E
※１：懸念される変異株(VOC; Variant of Concern) ※２：注目すべき変異株(VOI; Variant of Interest) ※３：監視中の変異株(VUM; Variant under Monitoring) ※４：以前監視されていた変異株(formerly monitored variants)

変異株解析の流れ

　新型コロナウイルス感染症例についてL452R変異(デルタ株等で確認される変異であり、オミクロン株には変異が確認されていない)スクリーニング検査を実施し、｢陰性｣(現在の国内における感染の主流であるデルタ株ではない)の場合には、オミクロン株への感染を疑い対応します。

　＜主な機関での変異株解析の流れ＞

WHO呼称	PANGO lineage	参考情報
WHO呼称	PANGO lineage	分類^*	L452R
ベータ	B.1.351	VOC	–
ガンマ	P.1		–
デルタ	B.1.617.2		〇
オミクロン	B.1.1.529		–
アルファ	B.1.1.7	VUM	–
カッパ	B.1.617.1		〇
ラムダ	C.37		–
ミュー	B.1.621		–

　－結果の解釈例－

変異ターゲット	英国型	南アフリカ型	ブラジル型	日本型
Ｅ４８４Ｋ	×	○	○	○
Ｎ５０１Ｙ	○	○	○	×
ｄｅｌ６９‐７０	○	×	×	×

　　〇陽性（変異あり）　× 陰性（変異なし）

弊社、変異株への対応について

サンプル

新型コロナウイルス変異株スクリーニング検査新規受託開始について

　新型コロナウイルス感染拡大は衰えることはなく、変異株による感染も世界的に増加してます。弊社では、新型コロナウイルス関連検査の需要の急速な増加に応えるべく、段階的に検査受託体制の強化および検査設備の拡充を図ってまいりました。
　弊社では、ＰＣＲ検査を行い陽性となったものについて厚生労働省および国立感染症研究所からの依頼に基づき、変異株のスクリーニング検査を行政検査として実施してまいりましたが、結果についてはご施設様に直接お返しはしていませんでした。このたび、昨今の感染状況や医療提供体制状況に鑑み、検査させていただきました結果について各ご施設様にご報告させていただく事となりましたのでご案内申し上げます。

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■実施内容及び実施日

　［実施日］　２０２１年　５月　８日（土）ご依頼分より変更

コード

検査項目

保存方法

所要日数

検査方法

基準値

４２６６

ＳＡＲＳ-ＣｏＶ-２Ｎ５０１Ｙ検査^※１

冷蔵

２～３

ＰＣＲ
（リアルタイムＲＴ－ＰＣＲ）

野生型
陽性（＋）
変異型
陰性（－）

※１本検査は、弊社にて下記対象検査項目をご依頼いただき、検査結果が陽性と確定したものを対象
としています。追加対象項目の結果が陽性と確定した時点で、変異株に共通で認められるN501Y
変異についてのスクリーニング検査を実施させていただきます。行政検査として実施いたします
ので追加料金等は発生いたしません。

　［変異株スクリーニング検査追加対象項目］

コード

検査項目

採取量(mL)
提出量(mL)

容器^※２

保存
方法

所要
日数

実施料
判断料

検査方法

基準値

０９８７

新型ｺﾛﾅｳｲﾙｽRNA定性

鼻咽頭･鼻腔
ぬぐい液

Ｐ１

冷蔵

２^※３

1800
微生

ＰＣＲ
(ﾘｱﾙﾀｲﾑRT-PCR)

陰性
（－）

喀痰２.０
唾液１.０

Ｐ１又はＬ１

※２本検査はＰＣＲメディア等、グアニジンを含むウイルス不活化剤入り容器では、検査結果に影響
を与える（偽陰性となる）ため受託できません。上記指定容器（Ｐ１、Ｌ１）にてご提出ください。

※３ＦＡＸでのご報告は、再検査を含め、翌朝、変異株スクリーニング検査の結果は翌夕となりますが、
検査キャパシティを大幅に超える受託があった場合、上記報告日数より遅延する可能性があります。

営業所一覧

地図中のアイコンをクリックすると住所と電話番号が表示されます。

サンプル

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コロナ関連情報（別ページ）

〇新規受託 → 変異株スクリーニング検査

〇安全なワクチン接種の為に → ワクチンとは

〇ＰＣＲ検査ご提出方法等 → ご提出方法

〇各国・地域の入国制限措置等
　→ ＊PCR検査方法等、入国条件

変異の起こる仕組み

〇ウイルスの特徴〇

　ウイルスは､蛋白質の外殻､内部に遺伝子(DNA、RNA)を持っただけの単純な構造の微生物です｡細菌のように栄養を摂取してエネルギーを生産するような生命活動は行いません｡たとえ栄養と水があったとしても､ウイルス単独では生存できません｡自分自身で増殖する能力が無く､生きた細胞の中でしか増殖できませんので､他の生物を利用して自己を複製することでのみ増殖します｡その過程で｢変異｣を繰り返し､より環境に適応しやすいよう姿を変えていきます｡

＜変異の過程＞

➀まず､ウイルス表面にある､とげ状の｢スパイクたんぱく質｣が､ヒトの細胞表面で受け手となる受容体たんぱく質(アンジオテンシン変換酵素2＝ACE2)に結合して細胞内へ侵入する｡

➁細胞内では､RNAの情報に従って､ウイルスの素材となるたんぱく質を翻訳(合成)する｡一方､RNAは大量に複製され､たんぱく質とともに組み立て･成熟が進んで｢子孫ウイルス｣ができ､それらが細胞外へ放出されていく｡

➂この過程で､RNA複製の際に一定の確率でミスが生じ､RNAを構成する塩基の配列が変わることがある｡この現象が｢変異｣と呼ばれる。

新型コロナにおける変異株

１. N501Yの変異株

• ｢N501Yの変異がある変異株｣は､従来株よりも感染しやすい可能性がある｡

• 英国で確認された変異株(VOC-202012/01)､南アフリカで確認された変異株(501Y.V2)､ブラジルで確認された変異株(501Y.V31)､フィリピンで確認された変異株がこの変異を有している｡

• 英国や南アフリカで確認された変異株については、重症化しやすい可能性も指摘されている。

• 4/6時点､国内事例886例､空港検疫152例の計1038例が確認されている｡

２. E484Kの変異株

• ｢E484Kの変異がある変異株｣は､従来株よりも､免疫やワクチンの効果を低下させる可能性^※１可能性も指摘されている｡

• 南アフリカで確認された変異株(501Y.V2)､ブラジルで確認された変異株(501Y.V3)､フィリピンで確認された変異株がこの変異を有している｡

※1 この変異のみでワクチンが無効化されるものではなく､ファイザー社のワクチンの場合は､承認審査において､モデルウイルスを用いた非臨床試験を通じ､種々の変異株にも一定の有効性が期待できるが､今後も変異を注視し､引き続き検討が必要とされている｡

※　上記のほかに､我が国では｢N501Yの変異はないがE484Kの変異がある変異株｣を計1,553例(国内1,548件､検疫5件)確認されている(2021/4/6時点)

３. L452RとE484Qの変異がある変異株

・インド由来とされ、英国株に続く「脅威」となると専門家が危ぶんでいる。
特にアジア系人種について免疫やワクチンの効果を低下させる可能性が指摘されている。

・インドの感染、１日３４万人インドの感染、１日３４万人。

・世界保健機関（ＷＨＯ）は４月下旬、インド株を「ＶＯＩ（注目すべき変異株）」に指定した。

Ｌ４５２Ｒ

Ｅ４８４Ｑ

感染力

感染力が強い

不明

免疫への影響

免疫力を低下

不明

４. その他、世界で確認されている変異株

　delH69V70､N501Y､E484K､K417N､K417T､N439K､D614G､A222V､Y453F､P681H､Q27stop､delY144､A570D､T716I､S982A､A1708D､A701V､L242_244L､D80A､L18F､R246I､D215G

N501Y・E484Kってなに

　最近､よく聞くけどN501Y･E484Kってなに？？

　｢まん延防止｣が適用された大阪｡４月５日に発表されたスクリーニング検査の結果､新たに２７０人が変異ウイルス陽性だったことがわかりました｡その変異ウイルス､日本では気になる２つの変異の種類があるんです｡

　｢Ｎ５０１Ｙ｣の変異があるのはイギリス型と呼ばれるもので､特に関西で広がっています｡一方､｢Ｅ４８４Ｋ｣のみの変異があるのはどこからきたタイプかはわかっていませんが､東京の陽性者のうち､およそ半数を占めています｡

　この数字とアルファベットが何なのかといいますとウイルスには人の細胞にくっつく重要な「突起」があるんですが、タンパク質の「５０１番目のアミノ酸がＮ(アスパラギン)からＹ(チロシン)に変わった」ということを示しています。変異そのものは頻繁に起こっているといいます。

アミノ酸略号

注:(A):酸性アミノ酸､(B):塩基性アミノ酸

＜その他変異＞

３. del 69-70の変異株

➀VOC-202012/01の変異の一つ､S遺伝子deletion 69-70により､S遺伝子を検出するPCRによっては､結果が偽陰性となるspike gene target failure(SGTF)を認めている

➁英国の3カ所の検査施設において､SGTFを認める検体が急増するとともに､10月12日の週にはSGTFを認める変異株のうちB.1.1.7に属するものが5%であったが､11月30日にはこの頻度が96%と急増していた

変異するとどうなる

＜変異すると＞

＜変異の種類と特徴＞

｢N501Y｣｢E484K｣変異の特徴は、

➀関西で多い｢Ｎ５０１Ｙ｣は、従来よりも感染力が強いとされています。一方、東京で多い｢Ｅ４８４Ｋ｣は、感染力は従来と変わらないとされています。東京よりも大阪の感染者が多いのはこのことも影響しているのかもしれません。

➁｢イギリス型｣｢南アフリカ型｣｢ブラジル型｣と呼ばれているウイルスなどはこの｢Ｎ５０１Ｙ｣の変異が見られ､｢イギリス型｣に限れば致死率は従来のおよそ１．６倍という報告もあります｡一方､｢南アフリカ型｣｢ブラジル型｣などには｢Ｅ４８４Ｋ｣の変異もあります｡この変異の注目すべき特性は｢免疫やワクチンの効果を低下させる可能性｣が指摘されている点です｡

➂｢変異によってワクチンの効果を弱めるものも出てくる可能性がある｡『Ｅ４８４Ｋ』がそれであるという確証はないが短期間で感染を押さえ込むことが重要だ｣

｢L452R｣変異の特徴は、

・インド型変異株ウイルスともいわれる

・日本人の６割が新型コロナウイルスに対する免疫反応・ワクチン効果が弱くなる

・原因は白血球の血液型であるHLA（ヒト白血球抗原）

白血球とは

・白血球とは血液の工場である骨髄中で作られる血液細胞です。

・ばい菌、ウイルス、カビなどから身を守るためにはたらきます。

・白血球にも血液型があります。（HLA；ヒト白血球抗原）

＜HLAとは＞

HLA（Human Leukocyte Antigen＝ヒト白血球抗原）は1954年、白血球の血液型として発見され、頭文字をとってこう呼ばれてきました。しかし、発見から半世紀以上を経て、HLAは白血球だけにあるのではなく、ほぼすべての細胞と体液に分布していて、組織適合性抗原(ヒトの免疫に関わる重要な分子)として働いていることが明らかになりました。

日本国内におけるA, B, DRの頻度は下記のようになっています。日本人の６割がHLA-A24を持っています。

Ａ

Ｂ

ＤＲ

ＨＦ

ＬＤ

Ａ２４

Ｂ５２

ＤＲ１５

８.２％

７.５

Ａ３３

Ｂ４４

ＤＲ１３

５.２％

５.１

Ａ２４

Ｂ７

ＤＲ１

３.６％

３.５

Ａ２４

Ｂ５４

ＤＲ４

２.３％

１.８

Ａ２

Ｂ４６

ＤＲ８

２.２％

２.１

HLAハプロタイプの頻度

Ａ　　　Ｂ　　　ＤＲ　　　ＨＦ（％）　ＬＤ
Ａ２４　Ｂ５２　ＤＲ１５　８.２％　　７.５
Ａ３３　Ｂ４４　ＤＲ１３　５.２％　　５.１
Ａ２４　Ｂ７　　ＤＲ１　　３.６％　　３.５
Ａ２４　Ｂ５４　ＤＲ４　　２.３％　　１.８
Ａ２　　Ｂ４６　ＤＲ８　　２.２％　　２.１
Ａ１１　Ｂ６２　ＤＲ４　　１.６％　　１.４
Ａ２６　Ｂ６１　ＤＲ９　　１.２％　　１.１
Ａ２　　Ｂ６１　ＤＲ９　　１.２％　　０.８
Ａ２　　Ｂ３５　ＤＲ４　　１.２％　　０.８
Ａ２４　Ｂ６１　ＤＲ９　　１.２％　　０.７
Ａ２４　Ｂ３５　ＤＲ４　　１.１％　　０.４
Ａ２４　Ｂ５１　ＤＲ４　　１.０％　　０.３
Ａ２　　Ｂ１３　ＤＲ１２　０.９％　　０.９
Ａ２４　Ｂ５９　ＤＲ４　　０.９％　　０.８
Ａ３１　Ｂ５１　ＤＲ８　　０.８％　　０.７
Ａ２６　Ｂ６２　ＤＲ９　　０.８％　　０.７
Ａ２６　Ｂ３５　ＤＲ１５　０.８％　　０.７
Ａ１１　Ｂ５４　ＤＲ４　　０.８％　　０.７
Ａ２　　Ｂ４６　ＤＲ９　　０.８％　　０.６
Ａ２４　Ｂ６２　ＤＲ４　　０.８％　　０.１
Ａ１１　Ｂ６７　ＤＲ１５　０.７％　　０.７
Ａ２　　Ｂ５９　ＤＲ４　　０.７％　　０.６
Ａ２　　Ｂ３９　ＤＲ１５　０.７％　　０.６
Ａ１１　Ｂ３９　ＤＲ８　　０.７％　　０.６
Ａ２６　Ｂ６２　ＤＲ１５　０.７％　　０.５
Ａ２　　Ｂ６０　ＤＲ４　　０.７％　　０.４
Ａ３３　Ｂ４４　ＤＲ８　　０.６％　　０.５
Ａ２４　Ｂ５５　ＤＲ４　　０.６％　　０.３
Ａ２４　Ｂ５４　ＤＲ８　　０.６％　　０.３
Ａ２　　Ｂ３９　ＤＲ４　　０.６％　　０.３
Ａ２４　Ｂ６０　ＤＲ４　　０.６％　　０.１
Ａ２　　Ｂ６１　ＤＲ４　　０.６％　　０.０
Ａ２４　Ｂ５２　ＤＲ８　　０.５％　　－０.１
Ａ３１　Ｂ５１　ＤＲ１２　０.５％　　０.５
Ａ３１　Ｂ６０　ＤＲ８　　０.５％　　０.４
Ａ２４　Ｂ７０　ＤＲ４　　０.５％　　０.４
Ａ２　　Ｂ７　　ＤＲ１　　０.５％　　０.４
Ａ２６　Ｂ３５　ＤＲ４　　０.５％　　０.３
Ａ２４　Ｂ６０　ＤＲ９　　０.５％　　０.３
Ａ２　　Ｂ４８　Ｒ１５　　０.５％　　０.３
Ａ１１　Ｂ３５　ＤＲ４　　０.５％　　０.３
Ａ２６　Ｂ５２　ＤＲ１５　０.５％　　０.２
Ａ２４　Ｂ６１　ＤＲ１２　０.５％　　０.２
Ａ２４　Ｂ４６　ＤＲ８　　０.５％　　０.２
Ａ２　　Ｂ６２　ＤＲ１５　０.５％　　０.２
Ａ２　　Ｂ５４　ＤＲ４　　０.５％　　０.２
Ａ２４　Ｂ５１　ＤＲ８　　０.５％　　０.１
Ａ２４　Ｂ５１　ＤＲ９　　０.５％　　０.１
Ａ２　　Ｂ６１　ＤＲ８　　０.５％　　０.１
Ａ２４　Ｂ６１　ＤＲ１５　０.４％　　－０.２
Ａ３３　Ｂ５８　ＤＲ１３　０.４％　　０.４
Ａ　　　Ｂ４８　ＤＲ４　　０.４％　　０.４
Ａ２　　Ｂ７５　ＤＲ９　　０.４％　　０.４
Ａ１　　Ｂ３７　ＤＲ１０　０.４％　　０.４
Ａ３１　Ｂ５１　ＤＲ９　　０.４％　　０.３
Ａ２４　Ｂ５１　ＤＲ１１　０.４％　　０.３
Ａ２４　Ｂ５１　ＤＲ２５　０.４％　　０.３
Ａ２４　Ｂ３５　ＤＲ１１　０.４％　　０.３
Ａ２　　Ｂ６１　ＤＲ１４　０.４％　　０.３
Ａ２　　Ｂ５１　ＤＲ１２　０.４％　　０.３
Ａ３１　Ｂ５１　ＤＲ４　　０.４％　　０.２
Ａ２６　Ｂ６１　ＤＲ８　　０.４％　　０.２
Ａ２４　Ｂ６１　ＤＲ１４　０.４％　　０.２
Ａ２４　Ｂ３５　ＤＲ１４　０.４％　　０.２
Ａ２　　Ｂ５４　ＤＲ８　　０.４％　　０.２
Ａ２　　Ｂ４４　ＤＲ１３　０.４％　　０.２
Ａ２４　Ｂ６０　ＤＲ１５　０.４％　　０.１
Ａ２　　Ｂ３５　ＤＲ１５　０.４％　　０.１
Ａ２４　Ｂ３５　ＤＲ１５　０.３％　　－０.２
Ａ２４　Ｂ７　　ＤＲ４　　０.３％　　－０.１
Ａ２４　Ｂ３５　ＤＲ９　　０.３％　　－０.１
Ａ２　　Ｂ５２　ＤＲ１５　０.３％　　－０.１
Ａ３１　Ｂ５１　ＤＲ２５　０.３％　　０.３
Ａ２６　Ｂ３５　ＤＲ１４　０.３％　　０.３
Ａ２４　Ｂ６１　ＤＲ４　　０.３％　　０.３
Ａ１１　Ｂ６７　ＤＲ１６　０.３％　　０.３
Ａ１１　Ｂ５５　ＤＲ１５　０.３％　　０.３
Ａ３１　Ｂ６１　ＤＲ８　　０.３％　　０.２
Ａ３１　Ｂ５６　ＤＲ９　　０.３％　　０.２
Ａ２６　Ｂ６２　ＤＲ８　　０.３％　　０.２
Ａ２６　Ｂ６０　ＤＲ１２　０.３％　　０.２
Ａ２６　Ｂ４８　ＤＲ４　　０.３％　　０.２
Ａ２４　Ｂ６１　ＤＲ９　　０.３％　　０.２
Ａ２４　Ｂ３５　ＤＲ４　　０.３％　　０.２
Ａ２　　Ｂ６０　ＤＲ９　　０.３％　　０.２
Ａ１１　Ｂ４８　ＤＲ９　　０.３％　　０.２
Ａ１１　Ｂ３５　ＤＲ８　　０.３％　　０.２
Ａ２６　Ｂ６２　ＤＲ４　　０.３％　　０.１
Ａ２６　Ｂ６１　ＤＲ４　　０.３％　　０.０
Ａ２　　Ｂ６２　ＤＲ９　　０.３％　　０.０
Ａ２　　Ｂ５１　ＤＲ８　　０.３％　　０.０
Ａ２　　Ｂ５１　ＤＲ９　　０.３％　　０.０
Ａ２　　Ｂ３５　ＤＲ８　　０.３％　　０.０
Ａ３　　Ｂ４４　ＤＲ１３　０.２％　　０.２
Ａ２６　Ｂ６２　ＤＲ１４　０.２％　　０.２
Ａ２　　Ｂ４６　ＤＲ１２　０.２％　　０.２
Ａ３１　Ｂ６１　ＤＲ９　　０.２％　　０.１
Ａ３１　Ｂ６１　ＤＲ４　　０.２％　　０.１
Ａ２　　Ｂ７０　ＤＲ４　　０.２％　　０.１
Ａ２　　Ｂ５５　ＤＲ４　　０.２％　　０.１
Ａ２　　Ｂ４８　ＤＲ４　　０.２％　　０.１
Ａ２　　Ｂ３９　ＤＲ９　　０.２％　　０.１
Ａ２　　Ｂ３５　ＤＲ９　　０.２％　　０.０

“白血球の型”

ＨＬＡ－Ａ２４

日本人の６割が保有

＜L452R変異による影響＞

　日本人の６割が新型コロナウイルスに対する免疫反応・ワクチン効果が弱くなる

オミクロン株の特徴は、

　オミクロン株は南アフリカが２０２１年１１月２４日に初めて世界保健機関（ＷＨＯ）に報告した新型コロナウイルスの変異株。ＷＨＯはアルファ株（英国）ベータ株（南アフリカ）ガンマ株（ブラジル）デルタ株（インド）に続く５番目の「懸念される変異株（ＶＯＣ）」に指定した。

新しい変異株の分類と呼称

変異株解析の流れ

　＜主な機関での変異株解析の流れ＞

－結果の解釈例－

〇陽性(変異あり)　× 陰性(変異なし)

弊社、変異株への対応について

新型コロナ変異株スクリーニング
検査新規受託開始について

　新型コロナウイルス感染拡大は衰えることはなく、変異株による感染も世界的に増加してます。弊社では、新型コロナウイルス関連検査の需要の急速な増加に応えるべく、段階的に検査受託体制の強化および検査設備の拡充を図ってまいりました。

　弊社では、変異株のスクリーニング検査について厚生労働省および国立感染症研究所からの依頼に基づき、これまでも行政検査として受託してまいりましたが、昨今の感染状況や医療提供体制状況に鑑み、一般クリニック等を含め、広く変異株スクリーニング検査を受託させていただくこととなりましたのでご案内申し上げます。

■詳細はこちら　→　

■実施内容及び実施日

［実施日］2021年5月 8日(土)ご依頼分より変更

コード

検査項目

保存方法

所要日数

検査方法

基準値

4266

ＳＡＲＳ-ＣｏＶ-２
Ｎ５０１Ｙ検査^※１

冷蔵

２～３

ＰＣＲ
(ﾘｱﾙﾀｲﾑRT-PCR)

野生型
陽性（＋）
変異型
陰性（－）

※１本検査は、弊社にて下記対象検査項目をご依頼いただき、検査結果が陽性と確定したものを対象としています。追加対象項目の結果が陽性と確定した時点で、変異株に共通で認められるN501Y変異についてのスクリーニング検査を実施させていただきます。行政検査として実施いたしますので追加料金等は発生いたしません。

［変異株スクリーニング検査追加対象項目］

コード

検査項目

採取量(mL)
提出量(mL)

容器^※２

保存
方法

所要
日数

実施料
判断料

検査方法

基準値

０９８７

新型ｺﾛﾅｳｲﾙｽ
RNA定性

鼻咽頭･鼻腔
ぬぐい液

Ｐ１

冷蔵

２^※３

1800
微生

ＰＣＲ
(ﾘｱﾙﾀｲﾑRT-PCR)

陰性
（－）

喀痰２.０
唾液１.０

Ｐ１又はＬ１

※２本検査はＰＣＲメディア等、グアニジンを含むウイルス不活化剤入り容器では、検査結果に影響を与える（偽陰性となる）ため受託できません。上記指定容器（Ｐ１、Ｌ１）にてご提出ください。

※３ＦＡＸでのご報告は、再検査を含め、翌朝、変異株スクリーニング検査の結果は翌夕となりますが、検査キャパシティを大幅に超える受託があった場合、上記報告日数より遅延する可能性があります。

営業所一覧

地図中のアイコンをクリックすると住所と電話番号が表示されます。

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